20151203 TMev String Panther

上課講師：辛老師

Mev 可以分析microassay的data

mev visualization

GDM

從上圖中可以看到與目標基因互相接近的幾個基因，分別是：

RALBP1

SMARCA4

DAB2

MYBBP1A

MT1H

最不相關的是：

SFPQ
SP3
SPDEF
NQ01

IVNS1BP
ENO11
UBC
USP11

GO relationship 可以由兩個網站獲得
1. http://pantherdb.org
2. http://string-db.org

Panther:

String:
蛋白質之間的關係

相關蛋白的名稱及功能

 蛋白質的數量可增減

 特殊功能：KEGG Pathway、biological processes、molecular function、cellular component

連接 天下雜誌

BLAST X 可以找到功能
BLAST